Aunque los síntomas pueden variar según la porción del cerebro afectada, suelen aparecer repentinamente y son rápidamente progresivos. Los síntomas más típicos son:

• Fiebre
• Convulsiones
• Cambios de comportamiento
• Disminución de la capacidad de respuesta
• Inclinación lateral de la cabeza
• Parálisis de la cara
• Movimientos descoordinados o en círculos
• Tamaño desigual de las pupilas (anisocoria)
• Pupilas puntiformes de menor tamaño
• Disminución de la conciencia, que puede empeorar a medida que la enfermedad progresa

La causa más común el el Moquillo, la Rabia o el Herpesvirus. Son enfermedades víricas que cada vez tienen menos incidencia por el uso de las vacunas.

Tambíen podría estar causada por:

• hongos que provocan infecciones micóticas
• bacterias que llegan hasta el cerebro provocando la inflamación
• ingestión de productos no adecuados como por ejemplo el plomo 

Finalmente tenemos la encefalitis postvacunal que se produce puntualmente tras la vacunación con virus modificados.

El veterinario en primer lugar preguntará por la aparición de los síntomas y realizará una exploración física. Si sospechara de la encefalitis, el diagnóstico definitivo requerirá de una muestra de líquido cefalorraquídeo. Para ello deberá realizar una punción espinal y enviar el líquido al Laboratorio para su análisis. El resultado del análisis será muy importante para determinar la causa de la encefalitis y poder recetar el mejor tratamiento.

El veterinario en primer lugar recetará corticoesteroides para reducir inflamación del cerebro del gato y anticonvulsivos si el gato presentara convulsiones.

En paralelo también tratará la causa que ha provocado la encefalitis. Utilizará antimicóticos si ha sido causada por hongos, antibioticos si la causa es bacteriana o tratará de eliminar los productos ingeridos nocivos.

Aunque se recupere, el gato puede seguir con secuelas neurológicas: básicamente convulsiones y descoordinación. Esto puede no ser reversible.