La bacteria E. coli es la que más infecciones provoca. Otras bacterias que también son bastante usuales en las infecciones del sistema urinario son la Staphylococcus y Proteus spp. Y ya en menor medida también podemos encontrar Streptococcus, Klebsiella, Enterobacter, Pseudomonas y Corynebacterium spp.
Para que la infección avance, las defensas del gato normalmente deben estar bajas. También influye el pH de la orina (el grado de acidez o alcalinidad de la orina) que está influido por la alimentación. Si tenemos una alimentación que alcaliniza la orina facilita la aparición de las infecciones. Otro factor es la frecuencia con la que orina el gato. Las bacterias no pueden avanzar si el gato orina con frecuencia